Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrc4Q3UP24 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms