Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms