Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHE1

Pitpnm3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm3Q3UHE1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms