Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Ighv10-4-201ENSMUST00000193702 299 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24590-201ENSMUST00000116699 119 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Il6-204ENSMUST00000199765 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 4930442G15Rik-201ENSMUST00000213112 1000 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r60-201ENSMUST00000173782 1007 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3099-202ENSMUST00000178274 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 mt-Nd3-201ENSMUST00000082411 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Npm1-204ENSMUST00000109354 1157 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms