Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnf40Q3U319 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rnf40Q3U319 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rnf40Q3U319 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf40Q3U319 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rnf40Q3U319 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf40Q3U319 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf40Q3U319 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf40Q3U319 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf40Q3U319 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Rnf40Q3U319 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf40Q3U319 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf40Q3U319 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf40Q3U319 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf40Q3U319 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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Rnf40Q3U319 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf40Q3U319 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf40Q3U319 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Rnf40Q3U319 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Rnf40Q3U319 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Rnf40Q3U319 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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