Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LcorlQ3U285 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LcorlQ3U285 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LcorlQ3U285 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LcorlQ3U285 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LcorlQ3U285 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
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LcorlQ3U285 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LcorlQ3U285 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LcorlQ3U285 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LcorlQ3U285 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LcorlQ3U285 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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LcorlQ3U285 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LcorlQ3U285 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LcorlQ3U285 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LcorlQ3U285 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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LcorlQ3U285 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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LcorlQ3U285 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LcorlQ3U285 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LcorlQ3U285 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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LcorlQ3U285 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LcorlQ3U285 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LcorlQ3U285 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LcorlQ3U285 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LcorlQ3U285 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LcorlQ3U285 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LcorlQ3U285 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LcorlQ3U285 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LcorlQ3U285 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LcorlQ3U285 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LcorlQ3U285 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LcorlQ3U285 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LcorlQ3U285 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LcorlQ3U285 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LcorlQ3U285 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
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LcorlQ3U285 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LcorlQ3U285 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LcorlQ3U285 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LcorlQ3U285 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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LcorlQ3U285 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LcorlQ3U285 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LcorlQ3U285 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LcorlQ3U285 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LcorlQ3U285 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LcorlQ3U285 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms