Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms