Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms