Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYU2

Atp13a5, Probable cation-transporting ATPase 13A5, mousemouse

Predictions only

Length 1,216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a5Q3TYU2 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms