Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TchpQ3TVW5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms