Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms