Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Usp39Q3TIX9 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Usp39Q3TIX9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Usp39Q3TIX9 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Usp39Q3TIX9 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Usp39Q3TIX9 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Usp39Q3TIX9 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp39Q3TIX9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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