Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms