Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXB8

Colec11, Collectin-11, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec11Q3SXB8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms