Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms