Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Shroom4Q1W617 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Shroom4Q1W617 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
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Shroom4Q1W617 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
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Shroom4Q1W617 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
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Shroom4Q1W617 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Shroom4Q1W617 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Shroom4Q1W617 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
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Shroom4Q1W617 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Shroom4Q1W617 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
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Shroom4Q1W617 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
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Shroom4Q1W617 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
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Shroom4Q1W617 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
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Shroom4Q1W617 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Shroom4Q1W617 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Shroom4Q1W617 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Shroom4Q1W617 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Shroom4Q1W617 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Shroom4Q1W617 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Shroom4Q1W617 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Shroom4Q1W617 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Shroom4Q1W617 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Shroom4Q1W617 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Shroom4Q1W617 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Shroom4Q1W617 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Shroom4Q1W617 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Shroom4Q1W617 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Shroom4Q1W617 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Shroom4Q1W617 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Shroom4Q1W617 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Shroom4Q1W617 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Shroom4Q1W617 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Shroom4Q1W617 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Shroom4Q1W617 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Shroom4Q1W617 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
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