Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Rpusd3Q14AI6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Rpusd3Q14AI6 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd3Q14AI6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms