Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssrp1Q08943 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms