Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms