Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms