Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdx4Q07424 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms