Protein–RNA interactions for Protein: Q06831

Sox4, Transcription factor SOX-4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox4Q06831 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sox4Q06831 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox4Q06831 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox4Q06831 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox4Q06831 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sox4Q06831 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox4Q06831 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox4Q06831 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Sox4Q06831 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Sox4Q06831 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Sox4Q06831 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox4Q06831 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox4Q06831 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox4Q06831 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Sox4Q06831 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox4Q06831 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sox4Q06831 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox4Q06831 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox4Q06831 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox4Q06831 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox4Q06831 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox4Q06831 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox4Q06831 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox4Q06831 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sox4Q06831 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox4Q06831 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox4Q06831 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox4Q06831 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox4Q06831 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sox4Q06831 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox4Q06831 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox4Q06831 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox4Q06831 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox4Q06831 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox4Q06831 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox4Q06831 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox4Q06831 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox4Q06831 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox4Q06831 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox4Q06831 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Sox4Q06831 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox4Q06831 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sox4Q06831 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Sox4Q06831 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox4Q06831 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox4Q06831 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sox4Q06831 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sox4Q06831 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sox4Q06831 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox4Q06831 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox4Q06831 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox4Q06831 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sox4Q06831 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sox4Q06831 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sox4Q06831 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox4Q06831 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox4Q06831 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sox4Q06831 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox4Q06831 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sox4Q06831 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox4Q06831 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox4Q06831 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox4Q06831 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox4Q06831 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox4Q06831 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sox4Q06831 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sox4Q06831 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sox4Q06831 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sox4Q06831 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sox4Q06831 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sox4Q06831 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sox4Q06831 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sox4Q06831 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sox4Q06831 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sox4Q06831 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Sox4Q06831 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sox4Q06831 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sox4Q06831 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sox4Q06831 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sox4Q06831 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sox4Q06831 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Sox4Q06831 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sox4Q06831 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Sox4Q06831 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Sox4Q06831 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sox4Q06831 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sox4Q06831 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Sox4Q06831 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sox4Q06831 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Sox4Q06831 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sox4Q06831 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sox4Q06831 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sox4Q06831 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sox4Q06831 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sox4Q06831 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sox4Q06831 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sox4Q06831 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sox4Q06831 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sox4Q06831 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sox4Q06831 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms