Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SPINDOCQ05AH6 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPINDOCQ05AH6 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPINDOCQ05AH6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPINDOCQ05AH6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPINDOCQ05AH6 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPINDOCQ05AH6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPINDOCQ05AH6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPINDOCQ05AH6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPINDOCQ05AH6 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPINDOCQ05AH6 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPINDOCQ05AH6 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPINDOCQ05AH6 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPINDOCQ05AH6 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPINDOCQ05AH6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPINDOCQ05AH6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPINDOCQ05AH6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPINDOCQ05AH6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SPINDOCQ05AH6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPINDOCQ05AH6 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPINDOCQ05AH6 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPINDOCQ05AH6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPINDOCQ05AH6 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPINDOCQ05AH6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPINDOCQ05AH6 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPINDOCQ05AH6 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPINDOCQ05AH6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPINDOCQ05AH6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPINDOCQ05AH6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPINDOCQ05AH6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPINDOCQ05AH6 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPINDOCQ05AH6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPINDOCQ05AH6 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPINDOCQ05AH6 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPINDOCQ05AH6 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SPINDOCQ05AH6 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SPINDOCQ05AH6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPINDOCQ05AH6 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPINDOCQ05AH6 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPINDOCQ05AH6 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPINDOCQ05AH6 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPINDOCQ05AH6 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPINDOCQ05AH6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPINDOCQ05AH6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPINDOCQ05AH6 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPINDOCQ05AH6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPINDOCQ05AH6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPINDOCQ05AH6 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPINDOCQ05AH6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPINDOCQ05AH6 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPINDOCQ05AH6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPINDOCQ05AH6 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPINDOCQ05AH6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPINDOCQ05AH6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SPINDOCQ05AH6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPINDOCQ05AH6 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPINDOCQ05AH6 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPINDOCQ05AH6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPINDOCQ05AH6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPINDOCQ05AH6 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPINDOCQ05AH6 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPINDOCQ05AH6 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPINDOCQ05AH6 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPINDOCQ05AH6 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPINDOCQ05AH6 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SPINDOCQ05AH6 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPINDOCQ05AH6 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPINDOCQ05AH6 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPINDOCQ05AH6 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms