Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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