Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcad1Q04692 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms