Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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