Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms