Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PrkcqQ02111 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcqQ02111 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms