Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RykQ01887 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RykQ01887 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RykQ01887 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RykQ01887 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RykQ01887 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RykQ01887 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RykQ01887 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RykQ01887 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RykQ01887 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RykQ01887 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RykQ01887 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RykQ01887 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RykQ01887 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RykQ01887 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RykQ01887 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RykQ01887 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RykQ01887 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RykQ01887 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RykQ01887 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RykQ01887 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RykQ01887 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RykQ01887 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RykQ01887 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RykQ01887 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RykQ01887 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RykQ01887 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RykQ01887 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RykQ01887 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RykQ01887 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
RykQ01887 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RykQ01887 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RykQ01887 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RykQ01887 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RykQ01887 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RykQ01887 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RykQ01887 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RykQ01887 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RykQ01887 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
RykQ01887 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RykQ01887 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RykQ01887 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RykQ01887 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RykQ01887 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RykQ01887 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RykQ01887 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RykQ01887 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RykQ01887 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RykQ01887 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RykQ01887 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RykQ01887 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RykQ01887 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RykQ01887 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RykQ01887 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RykQ01887 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
RykQ01887 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RykQ01887 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RykQ01887 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RykQ01887 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RykQ01887 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RykQ01887 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RykQ01887 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RykQ01887 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RykQ01887 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RykQ01887 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RykQ01887 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RykQ01887 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RykQ01887 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RykQ01887 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RykQ01887 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RykQ01887 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RykQ01887 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RykQ01887 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RykQ01887 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RykQ01887 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RykQ01887 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RykQ01887 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RykQ01887 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RykQ01887 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RykQ01887 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RykQ01887 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RykQ01887 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
RykQ01887 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RykQ01887 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RykQ01887 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
RykQ01887 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RykQ01887 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RykQ01887 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RykQ01887 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RykQ01887 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
RykQ01887 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RykQ01887 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RykQ01887 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RykQ01887 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
RykQ01887 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RykQ01887 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RykQ01887 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RykQ01887 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RykQ01887 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RykQ01887 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms