Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms