Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms