Protein–RNA interactions for Protein: P97929

Brca2, Breast cancer type 2 susceptibility protein homolog, mousemouse

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Length 3,329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca2P97929 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Brca2P97929 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Brca2P97929 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Brca2P97929 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Brca2P97929 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Brca2P97929 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Brca2P97929 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Brca2P97929 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Brca2P97929 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Brca2P97929 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Brca2P97929 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Brca2P97929 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Brca2P97929 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Brca2P97929 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Brca2P97929 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Brca2P97929 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Brca2P97929 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Brca2P97929 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Brca2P97929 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Brca2P97929 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Brca2P97929 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Brca2P97929 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Brca2P97929 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Brca2P97929 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Brca2P97929 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Brca2P97929 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Brca2P97929 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Brca2P97929 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Brca2P97929 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Brca2P97929 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Brca2P97929 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Brca2P97929 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Brca2P97929 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Brca2P97929 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Brca2P97929 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Brca2P97929 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Brca2P97929 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Brca2P97929 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Brca2P97929 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Brca2P97929 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Brca2P97929 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brca2P97929 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Brca2P97929 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brca2P97929 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brca2P97929 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brca2P97929 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brca2P97929 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brca2P97929 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brca2P97929 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brca2P97929 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brca2P97929 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brca2P97929 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brca2P97929 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brca2P97929 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Brca2P97929 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brca2P97929 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brca2P97929 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brca2P97929 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brca2P97929 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brca2P97929 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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