Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psme1P97371 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Psme1P97371 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Psme1P97371 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psme1P97371 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psme1P97371 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Psme1P97371 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Psme1P97371 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Psme1P97371 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Psme1P97371 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Psme1P97371 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Psme1P97371 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Psme1P97371 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms