Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Otx2P80206 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Otx2P80206 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Otx2P80206 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Otx2P80206 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Otx2P80206 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Otx2P80206 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Otx2P80206 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Otx2P80206 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Otx2P80206 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Otx2P80206 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms