Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad1P70340 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad1P70340 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad1P70340 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad1P70340 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad1P70340 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smad1P70340 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms