Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sycp3P70281 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms