Protein–RNA interactions for Protein: P68500

Cntn5, Contactin-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn5P68500 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms