Protein–RNA interactions for Protein: P63038

Hspd1, 60 kDa heat shock protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 573 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspd1P63038 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hspd1P63038 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms