Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpfP62307 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms