Protein–RNA interactions for Protein: P61375

Lhx5, LIM/homeobox protein Lhx5, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx5P61375 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx5P61375 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx5P61375 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx5P61375 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx5P61375 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx5P61375 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx5P61375 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx5P61375 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx5P61375 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx5P61375 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx5P61375 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx5P61375 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx5P61375 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx5P61375 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx5P61375 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx5P61375 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx5P61375 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx5P61375 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx5P61375 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx5P61375 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx5P61375 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx5P61375 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx5P61375 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms