Protein–RNA interactions for Protein: P61219

Polr2f, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2fP61219 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr2fP61219 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr2fP61219 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr2fP61219 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr2fP61219 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr2fP61219 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr2fP61219 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr2fP61219 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr2fP61219 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr2fP61219 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr2fP61219 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr2fP61219 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr2fP61219 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr2fP61219 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr2fP61219 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr2fP61219 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr2fP61219 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr2fP61219 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2fP61219 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms