Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snap25P60879 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snap25P60879 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snap25P60879 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snap25P60879 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snap25P60879 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snap25P60879 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Snap25P60879 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms