Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Paxbp1P58501 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms