Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Setd4P58467 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Setd4P58467 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Setd4P58467 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Setd4P58467 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Setd4P58467 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Setd4P58467 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Setd4P58467 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Setd4P58467 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Setd4P58467 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Setd4P58467 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Setd4P58467 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Setd4P58467 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Setd4P58467 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Setd4P58467 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Setd4P58467 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Setd4P58467 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Setd4P58467 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Setd4P58467 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Setd4P58467 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Setd4P58467 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Setd4P58467 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Setd4P58467 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Setd4P58467 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Setd4P58467 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Setd4P58467 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Setd4P58467 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Setd4P58467 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Setd4P58467 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Setd4P58467 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Setd4P58467 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Setd4P58467 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Setd4P58467 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Setd4P58467 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Setd4P58467 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Setd4P58467 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Setd4P58467 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Setd4P58467 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Setd4P58467 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Setd4P58467 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Setd4P58467 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Setd4P58467 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Setd4P58467 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Setd4P58467 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Setd4P58467 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Setd4P58467 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Setd4P58467 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Setd4P58467 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Setd4P58467 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Setd4P58467 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Setd4P58467 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Setd4P58467 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Setd4P58467 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Setd4P58467 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Setd4P58467 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Setd4P58467 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Setd4P58467 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Setd4P58467 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Setd4P58467 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Setd4P58467 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Setd4P58467 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Setd4P58467 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Setd4P58467 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Setd4P58467 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Setd4P58467 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Setd4P58467 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Setd4P58467 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Setd4P58467 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Setd4P58467 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Setd4P58467 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Setd4P58467 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Setd4P58467 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Setd4P58467 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Setd4P58467 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Setd4P58467 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Setd4P58467 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Setd4P58467 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Setd4P58467 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms