Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Fdft1P53798 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms