Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cux1P53564 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cux1P53564 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cux1P53564 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cux1P53564 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cux1P53564 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cux1P53564 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cux1P53564 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cux1P53564 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cux1P53564 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cux1P53564 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cux1P53564 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cux1P53564 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cux1P53564 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cux1P53564 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cux1P53564 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cux1P53564 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cux1P53564 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cux1P53564 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cux1P53564 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cux1P53564 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cux1P53564 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cux1P53564 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cux1P53564 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cux1P53564 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cux1P53564 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cux1P53564 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cux1P53564 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cux1P53564 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cux1P53564 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cux1P53564 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cux1P53564 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cux1P53564 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cux1P53564 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cux1P53564 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cux1P53564 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cux1P53564 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cux1P53564 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cux1P53564 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cux1P53564 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cux1P53564 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cux1P53564 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cux1P53564 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cux1P53564 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cux1P53564 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cux1P53564 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cux1P53564 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cux1P53564 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cux1P53564 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cux1P53564 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cux1P53564 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cux1P53564 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cux1P53564 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms