Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Map3k1P53349 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Map3k1P53349 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Map3k1P53349 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Map3k1P53349 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Map3k1P53349 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Map3k1P53349 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Map3k1P53349 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Map3k1P53349 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Map3k1P53349 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Map3k1P53349 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Map3k1P53349 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Map3k1P53349 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Map3k1P53349 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Map3k1P53349 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Map3k1P53349 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Map3k1P53349 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Map3k1P53349 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Map3k1P53349 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Map3k1P53349 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms