Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upp1P52624 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upp1P52624 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upp1P52624 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upp1P52624 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upp1P52624 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Upp1P52624 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upp1P52624 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms