Protein–RNA interactions for Protein: P50716

Defa-rs12, Alpha-defensin-related sequence 12, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs12P50716 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa-rs12P50716 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa-rs12P50716 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa-rs12P50716 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa-rs12P50716 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa-rs12P50716 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa-rs12P50716 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa-rs12P50716 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa-rs12P50716 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa-rs12P50716 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa-rs12P50716 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa-rs12P50716 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa-rs12P50716 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa-rs12P50716 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa-rs12P50716 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa-rs12P50716 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa-rs12P50716 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms