Protein–RNA interactions for Protein: P50481

Lhx3, LIM/homeobox protein Lhx3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx3P50481 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms